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国家甘薯改良中心: 甘薯品种资源研究室; 甘薯遗传育种研究室; 甘薯生理栽培研究室; 甘薯病虫草害防控研究室; 甘薯加工利用研究室; 植物品种测试技术研究室

区域农业研究: 小麦研究室; 水稻研究室; 特粮特经研究室; 油料研究室; 园艺研究室; 中心实验室; 铜山试验站

行政办公: 办公室; 科研管理处; 财务处; 发展与保障处; 科技服务中心; 科研基地管理办公室; 纪委办公室

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